....è un'applicazione software di calcolo distribuito creata per gestire progetti di ricerca che richiedono una potenza di calcolo così elevata da essere impossibile raggiungere con un solo supercomputer, ma accessibile attraverso la collaborazione di centinaia di migliaia di computer sparsi in tutto il mondo, coordinati attraverso Internet. Viene sviluppata da un gruppo di lavoro dell' Università di Berkeley diretto da David Anderson.

Il progetto più famoso da cui cominciò tutto fu il Seti@home, un esperimento scientifico che usa computer connessi ad internet per la ricerca di intelligenza extraterrestre (SETI) analizzando dati provenienti da radio telescopi.

Come dicevo, il progetto si basa sull'analisi di segnali captati dai radiotelescopi. Si cercano forme di segnale a larghezza di banda molto stretta. E' noto che questo tipo di segnali non sono presenti in natura. La loro scoperta sarebbe una prova evidente della presenza di una tecnologia extraterrestre.
I segnali dei radiotelescopi sono composti prevalentemente da rumore e da segnali prodotti dall'uomo come le stazioni TV, radio, satelliti artificiali. Nel corso degli anni sono stati analizzati alcuni segnali importanti, detti "Candidate". I segnali rianalizzati comunque non hanno dato ancora nessun esito positivo, ma ciò non vuol dire che in un prossimo futuro non ce ne siano.

In passato il progetto SETI utilizzava un supercomputer nei pressi del radiotelescopio per analizzare i dati. Nel 1995, David Gedye ha proposto di dar vita al radio SETI usando un supercomputer virtuale composto da un gran numero di computer connessi a Internet, Da questa idea è nato il SETI@home project.

SETI@home è stato avviato originalmente nel maggio 1999.
Nel settembre 2004 una notizia è stata diffusa in tutto il mondo: Intercettata dal radio telescopio di Arecibo un'onda radio anomala. Secondo i ricercatori non si tratta di una sorgente di emissione naturale. L'impulso e' stato nominato SHGB02+14A e viaggia sulla frequenza di 1420 MhZ. Questo segnale, come tanti altri è stato inserito nella lista del progetto Seti come segnale Candidate.

Nota curiosa: Chi di voi non ricorda il Film CONTACT con Jodie Foster?

Uno screenshot del vecchio Seti Classic mentre elabora un segnale

Uno screenshot del nuovo Seti@home mentre elabora un segnale

Ma Boinc non è solo Seti@home, ma un insieme di algoritmi (progetti) che negli ultimi hanno sono nati a favore della ricerca, quali astronomia, chimica, fisica, lo studio del clima, delle proteine, la matematica, la biologia e la medicina e tanto altro ancora.

Che cos’è il calcolo distribuito e perché tutti noi dovremmo interessarcene?

La risposta è molto semplice e al tempo stesso di grande importanza. Vediamo insieme di cosa si tratta.
I mezzi informatici, che sono uno strumento fenomenale in quanto hanno permesso di accelerare considerevolmente il progresso dell’umanità, sono sempre più fondamentali in qualsivoglia ambito di ricerca scientifica, dalla medicina alla fisica, dalla meteorologia allo studio del cosmo.
Sebbene la potenza dei calcolatori vada aumentando di anno in anno, la necessità di capacità di calcolo risulta spesso maggiore di ciò che le possibilità economiche degli enti di ricerca offrono. Come fare per ovviare a questo problema?
Una soluzione c’è, e qui entra in gioco il “calcolo distribuito”. Dislocati su tutto il pianeta ci sono oltre un miliardo di personal computer - 25 milioni in Italia - che generalmente vengono sfruttati solamente per una minima percentuale delle proprie capacità.
Da qui la geniale idea alla base del “calcolo distribuito”: unire le forze di tanti computer per realizzare potenze di calcolo enormi, sfruttando appunto le risorse inutilizzate dei nostri computer.
Per usare al meglio tutta questa potenza, i ricercatori del progetto Seti dell’Università di Berkeley hanno sviluppato il software BOINC (Berkeley Open Infrastructure for Network Computing), una nuova e potente piattaforma per il calcolo distribuito che sfrutta le risorse dei PC offerte volontariamente.
BOINC.Italy è nato quando alcuni utenti italiani hanno scelto di appoggiare vari progetti che utilizzano questa piattaforma creando un proprio gruppo di calcolo e invitando chiunque voglia a farne parte. Vediamo in dettaglio di cosa si tratta.

Come funziona?

Il processo con cui funzionano i progetti di calcolo distribuito è semplice e non c’è bisogno di alcuna conoscenza tecnica per contribuirvi. La prima volta che si avvia BOINC viene chiesto a quale progetto vogliamo aderire. Se ne può scegliere uno o anche più di uno. Da questo punto in poi tutto avviene in modo automatico. Ogni progetto scaricherà sul PC il proprio CLIENT, cioè il programma che si occuperà di elaborare i dati. Il programma BOINC si connetterà ad Internet, scaricherà dei pacchetti di dati (chiamati Work Units o anche tasks, abbreviato WUs), li farà elaborare al nostro PC tramite il client del progetto e, completata la Work Unit, provvederà a riportare i risultati ed a acquisire nuove WUs. Durante l’elaborazione non è necessario restare connessi ad Internet.
È possibile elaborare questi dati sul proprio PC quando si vuole, in generale in ogni attimo durante il quale il PC, e in particolare il processore, non viene utilizzato in nessuna operazione o compito gravoso. Si può utilizzare la potenza di calcolo del proprio computer per elaborare mentre si naviga, si scrive una relazione, si legge la posta e persino mentre si guarda un film.
È possibile spegnere il proprio computer in qualsiasi momento, l’elaborazione dei dati si interrompe e riprende automaticamente dal punto in cui si era fermata non appena il PC viene riacceso.
L’elaborazione avviene a priorità bassa, il che significa che non si noterà nessun rallentamento del PC in quanto, quando gli altri programmi richiedono l’uso del processore, BOINC "si fa da parte" e concede la precedenza.
Durante l'elaborazione il processore lavora al pieno delle sue capacità. Questo non deve spaventarvi: i computer sono fatti apposta per lavorare e non si danneggiano se le temperature restano nella norma. Nessun pericolo quindi a meno che non abbiate modificato qualcosa in modo improprio o non abbiate piazzato il PC di fianco al termosifone! Anzi, per dirla tutta, sono molto più pericolosi gli sbalzi di tensione che ricevono quando vengono accesi o spenti.

Alcune considerazioni

Chi aderisce a un progetto di ricerca non lo fa per ricevere premi o denaro ma per poter dire di aver dato una mano. Tanti più pacchetti di dati elaboreremo, tanto più saremo utili alla ricerca.
Tuttavia è importante sottolineare che aderendo a un progetto di “calcolo distribuito” non prenderemo nessun impegno vincolante: non ci sono risultati minimi da raggiungere. Chiunque potrà contribuire in maniera spontanea alla ricerca scientifica, lo farà per il tempo che vorrà e con quanti computer vorrà. Alla fine ci sembrerà come una sciocchezza da quant'è facile ma il nostro contributo avrà un valore ben più importante, lo avremo fatto per noi stessi quanto per gli altri. Il “calcolo distribuito” va interpretato come una nuova forma di beneficenza o di volontariato, e una volta iniziato sarà difficile non appassionarsi ad esso.
(fonte: www.boincitaly.org)

Si proprio così, mi trovo pienamente d' accordo con le considerazioni fatte dal portale BoincItaly.org, ma volgio dire qualcosa in più.

Quanti di noi hanno mai fatto una donazione a favore di qualche ente benefico? Tanti, penso quasi tutti quelli che leggeranno questo articolo, ma vi pongo una domanda, siamo sicuri che quello che facciamo sia veramente giusto? Detto così sembra una cattiveria, quello che voglio dire è che solo una minima parte che doniamo va effettivamente alla ricerca, diciamo un 10-20% ? Si avete letto, la media è del 10-20%, bene, anzi male, normalmente se doniamo 10 Euro, solo 1 o 2 Euro vengono utilizzati per la ricerca. L'altro 80% se ne va tra pubblicità, per la gestione del personale, per la stampa dei foglietti illustrativi e bollettini postali, e per tutto l' indotto che c'è dietro.

Allora mi chiedo una cosa, non è meglio spendere 50 Euro l'anno in più di energia elettrica per l'elaborazione sulla piattaforma BOINC dei vari progetti (che l'utente può scegliere)? Non può questa essere considerata una donazione? Secondo me si, in quanto i miei 50 Euro spesi in più aiutano VERAMENTE gli scienziati nell'elaborazione di dati che altrimenti non potrebbero fare.

Sulla piattaforma BOINC ci sono progetti molto nobili, quali Rosetta@home un progetto di Calcolo distribuito per predire le strutture delle proteine. Lo scopo del progetto infatti si occupa di prevedere la struttura tridimensionale delle proteine e le interazioni tra di esse. Lo studio di queste caratteristiche potrebbe portare alla scoperta di cure per alcune delle più diffuse malattie. Le proteine infatti sono i mattoni alla base di tutte le funzioni cellulari ed ognuna ha una funzione diversa data dalla sua struttura che, a sua volta, è data dagli amminoacidi che la compongono.
Quindi, conoscere la struttura equivale a conoscere le funzioni. Aumentando la conoscenza in questo campo, i ricercatori saranno in futuro in grado di dire quali proteine potrebbero essere utili per la cura di varie malattie (come AIDS; Cancro, Malaria o Morbo d'Alzheimer) e persino di modellarne di nuove quando necessario.

Uno screenshot di rosetta mentre "predice" la struttura di una proteina

Uno screenshot di una TOP PREDICTION trovata grazie a Rosetta@Home

Mi piace dire che BOINC è davvero uno strumento geniale e da giorno dopo giorno un concreto aiuto alla ricerca.

Elenco di seguito alcuni progetti con i relativi link:

Astronomia, fisica e chimica

• Seti@Home
  Seti@Home su Boincitaly.org
• LHC@Home
  LHC@Home su Boincitaly.org
• Cosmology@Home
  Cosmology@Home su Boincitaly.org
• Einstein@Home
• Einstein@Home su Boincitaly.org

Biologia e Medicina

• Rosetta@Home
  Rosetta@Home su Boincitaly.org
• Poem@Home
  Poem@home su Boincitaly.org
• Simap@Home
  Simap@Home su Boincitaly.org
• World Community Grid
  World Community Grid su Boinitaly.org

Clima

• Climate Prediction
  Climate Prediction su Boincitaly.org

Matematica

• ABC@Home
  ABC@Home su Boincitaly.org
• PrimeGrid
  PrimeGrid su Boincitaly.org

Ricordo che questi SONO SOLO ALCUNI dei progetti più popolari ma ognuno di noi se vuole può scaricarsi il BOINC e scegliere a quale progetto partecipare ed aiutare così la ricerca contro le malattie e non solo.

Per chi vuolesse partecipare cliccate sul logo del Boinc e scaricare il software e se volete entrate nel Team di BoincItaly di cui faccio parte anche io. Non esitate a lasciare un commento se non sapete come iniziare.

La Ricerca ha bisogno anche di VOI!

Entweder nimmt baut man dann eine riesige Serverfarm auf, oder man teilt das Projekt in unzählige kleine Stücke und verteilt sie auf viele andere PCs.

Nach der zuletzt genannten Methode geht das BOINC-Programm vor. Nach der Installation von BOINC kann man sich eins oder mehrere der vielen Projekte aussuchen, welche man unterstützen möchte. BOINC verbindet sich dann selbstständig mit den ausgewählten Projekten und lädt sich die zugewiesenen Einheiten (Units) runter. Dabei braucht man nicht mal Angst um einen lahmenden PC zu haben, denn BOINC nutzt nur die ungenutzten PC-Ressourcen. Das heißt, sobald man irgend etwas startet, was viele Ressourcen verbraucht, gibt BOINC diese auch augenblicklich wieder frei. Eine Übersicht aller Projekte findet man unter folgendem Link.

Wenn ihr euch nun entschieden habt auch Crunsher bei BOINC zu werden könnt ihr hier eine Installationsanleitung finden. (Ab Punkt 2.)

Ich persönlich lasse BOINC gerade für das World Community Grid laufen. Auch empfehlenswert ist Rosetta@Home, bei welchem ich auch schon gerechnet habe. Bei dem Projekt geht es um Protein Folding, die Erforschung der 3D-Struktur der Proteine. (Dadurch könnten Krankheiten wie etwa Krebs verhindert werden).

Viel Spaß

~Wegi

all you have to do is, sudo apt-get install boinc-manager boinc-client and it should be able to handle setting up your account for you, here's some more information https://wiki.ubuntu.com/BOINC

you then need to pick a project to 'attach' to, you can attach to more than one if you wish; you can find a list here: http://boinc.berkeley.edu/projects.php. Personally I would go for a 'proper' project, in that its one thats worth dedicating your CPU you to, rather than something like SHA-1 Collision Search Graz (which attempts to find collisions in the SHA-1 hash code) or SETI@home (which tries to find signs of life in the rest of the universe), but that's just my personal choice. i would recommend the following, World Community Grid - Rosetta@home - Climateprediction.net.

once you are setup with a project and its all running nicely don't forget to sign up to a team! its nothing more than a bit of fun but its nice, of course if you happen to run Rosetta@home like I do then I would suggest joining the Ubuntu Linux team :)

Finally just a quick note; these projects use your spare CPU cycles, that is that they run at a higher 'nice' value than your normal programs (a larger nice value means that the program will sit back and let another program take all the CPU cycles it needs) so your performance should not be affected in a meaningful way, these programs do take up ram though so i would recommend having at least 256MB ram above the Ubuntu minimum suggested ram (for your version, whatever that is).

The NCSA wrote a very easy to understand, yet quite complete article with explanations about David Baker's Rosetta project, an theoretical approach to deduct a protein's structure using computer-simulations.

Things I learned from this article:

1. The code does not start with a "flat" protein-molecule, starting to wiggle it around, but with a "homologous known protein structure" as a starting point. I don't understand if that's good or bad, but it limits the permutations to be checked.
2. David created a portal known as Robetta, where other biologists can submit their models to be crunched.
3. The Rosetta-project (not to be confused with Rosetta@home) uses a lot of CPU-hours on NCSA's clusters and supercomputers (Tungsten Linux Cluster, NCSA Condor Flock, and now possibly TeraGrid resources)

However, quite a nice read, go and grab it while it's hot!

Tech Tags: BOINC distributed computing Rosetta@home Science

RALPH@home is the official alpha test project for Rosetta@home. New application versions, work units, and updates in general will be tested here before being used for production. The goal for RALPH@home is to improve Rosetta@home.

So if you got any spare CPU-cycles and want to help improving cutting-edge rosetta@home applications, go and sign up!

Tech Tags: rosett@home boinc ralph@home distributed compunting

Also, if you followed David Baker's request for more more power, keep in mind that CASP7 will be partly re-evaluated and that further crunching helps science, although CASP7 is over.

Please keep also in mind that Rosetta@home got a 10-mio.-USD grant from the Melinda and Bill Gates foundation for searching a vaccine against the HI-virus. We don't know yet when those new WUs will be issued, stay tuned for further updates.

Thanks you for crunching for Rosetta@home.

Tags:
rosetta@home, boinc, science, distributed computing, casp